自然流产是一个复杂的问题，如果反复流产二次以上，即是习惯性流产。原因之一就与染色体异常有密切关系。在一般情况下，一个生育期的妇女，若连续二次自然流产，经常用检测手段没有发现疾病者，应考虑夫妇中某一方是否染色体异常。
染色体异常并不罕见，大约人群中每五百人就可能有一人是染色体易位。染色体易位，是在人类个体“复制信息”的染色体上存在着许许多多决定遗传性状的基因，这种遗传基因“信息”若发生异常，或断裂、或缺失、或“嫁接”到其他染色体上，将本来长短、结构正常的染色体性状改变，这样就会发生不幸。异常的染色体假如产生于精子之中，这种带病的精子与正常的卵子结合，则形成一个具有先天缺陷的受精卵。受精卵开始即使可以在宫腔内成话一段时间，但活力极差，往往在胚胎早期就会夭折，发生死胎与流产，难以成活到分娩。
据临床观察，约有二分之一的自然流产是由于染色体异常所致。由于精子的变异、劣质，受孕的结果常常是屡次怀孕屡次流产。其实，这是自然的选择、优生的需要。染色体异常，不仅仅局限于男性，女性的染色体也会发生。
之所以人类好端端的生殖细胞一精子中染色体会发生异位，原因是多方面的。到目前为止，医学界对这一问题的研究尚没有十分确切的结论。不过，大多数学者认为，染色体易位与内分泌紊乱有关，特别是育龄较大的女性，很容易导致卵子染色体易位。除此之外，滥用药物、大气污染、饮食污染、电磁波污染、放射线污染等等，也是导致染色体易位的常见因素。在欧洲一些国家就已经发现，在7-8月份怀孕的农民妇女中，染色体发生异常者明显高于其他月份的妇女，这是由于夏季接触杀虫剂及除草剂污染了她们食用的粮食、蔬菜、水果，造成了生育上的“悲剧”。还有人观察过，冬天在怀孕前后喜双使用电热毯的夫妇，发生自然流产者有增多趋势，这有可能与精子或卵子瘙遭受电热、电磁波污染有关。
生殖细胞中染色体异常的原因是多方面的。凡是染色体异常导致的流产，胎儿一般是保不注的，即使保住也是崎形儿，因而不直盲目保胎。染色体异常之后，一般没有理想的治疗方法，人们能够做到的是，部分患者是可以找到发病原因，凡是属于药物所致、饮食污染、电磁波污染，可以尽力避免；如果是男性内分泌异常所致，就应当进行系统检查，找出具体原因，有针对性地治疗。这种治疗不是发生在出现染色体之后，而是在发生之前的治疗与预防。