一、一般性诊断
包括病史询问（内、外、产科史、代谢病史、感染中，宫内有无异物存放，有无药物中毒，接受放射线治疗等），体检及盆腔检查时应注意子宫大小、位置，附件情况，基础体温测定，宫内膜检查，子宫输卵管造影，必要时作宫腔镜和腹腔镜检查。实验室检查包括血常规、血沉、血型及精液常规等。
二、特殊检查
1、对疑有遗传性疾病者，夫妇双方均应做染色体核型检查，或进一步做夫妇的家系遗传学调查和系谱绘制。2、激素测定，包括雌激素和孕激素、绒毛膜促性腺激素等的定量检测。3、尿、宫颈粘液培养了解有无微生物感染。4、对于流产后妊娠物的病理解剖及细胞遗传学的研究。5、怀疑患自身免疫性疾病者要检测APA。
经以上全面检查，逐一排除常见原因而病因仍不明者，应疑为免疫性习惯性流产，需做免疫学检查。
三、免疫学检查
1、首先应用混合淋巴细胞培养反应(MLR)及淋巴细胞毒性抗体测定，鉴别原发性与继发性流产。2、抗精子抗体的测定。3、血型及抗血型抗体测定。